Firma powstała pod nazwą General Aviation Sp. z o.o., z siedzibą w Góraszce. Podstawowym jej celem (firma uzyskała także pierwszy certyfikat lotnictwa cywilnego w tym zakresie) było prowadzenie działalności komercyjnej polegającej na wykonywaniu przelotów rekreacyjnych i krajoznawczych na samolotach typu AN-2.
Udziałowcy spółki dokonali aportu rzeczowego w postaci lądowiska o powierzchni 36 ha z terenem zabudowanym. W trakcie procesu rozbudowy spółki została wykupiona firma Aeropol świadcząca usługi lotnicze, co skutkowało powiększeniem floty o samoloty typu L-410 i helikoptery Mi-2.
W lutym 1995 White Eagle Aviation została przeniesiona na lotnisko Okęcie, a w marcu uruchomiono loty regularne dla UPS. W maju 1996 roku WEA powiększyła flotę o kolejny samolot typu L-410 i rozpoczęto przeloty dla Poczty Polskiej.
W styczniu 1997 uruchomiono przeloty przy wykorzystaniu nowego samolotu Bell 407. W tym samym roku zarejestrowano pod znakami WEA samolot F-27 w celu wykonywania operacji dla UPS na trasie Warszawa-Koln-Warszawa. W październiku 1997 WEA podpisała kontrakt z rządem izraelskim na wykonywanie pasażerskich przelotów nieregularnych samolotem JAK-40.
W latach 1996-2001 Spółka wykonywała przeloty regularne i nieregularne cargo dla UPS i TNT na samolotach Fokker F-27 i Let-410, nieregularne i regularne przeloty pasażerskie dla El-Al do 10 miejsc przeznaczenia na terenie dawnego ZSRR (JAK-40), regularne przeloty dla Poczty Polskiej (przez pięć dni w tygodniu), usługi typu „Aero-taxi”, patrolowanie i przeloty awaryjne przy wykorzystaniu samolotów : JAK-40, Beechcraft Super KingAir 350, Bonanza, Bell 407, Let-410, Mi-8, a także wykonywała usługi specjalne przy wykorzystaniu helikoptera (montaż konstrukcji stalowych, akcje ratownicze, itd.). Od roku 1998 rozpoczęto wykonywanie operacji lotniczych na samolotach Beechcraft Super KingAir 350 i Bell 407 na podstawie długoterminowych kontraktów podpisanych z dużymi firmami korporacyjnymi.
W roku 1998 Zarząd WEA zadecydował o zmianie prawnej formy działalności spółki przekształcając ją w spółkę akcyjną. Z firmy wydzielono także lotnisko Góraszka, które stało się własnością oddzielnej spółki występującej odtąd pod nazwą „General Aviation Sp. z o.o.”
W roku 2001 pojawił się nowy inwestor WEA - TUI Group, touroperator europejski, pozyskując 30% udział, w kapitale zakładowym WEA co zaowocowało rozwinięciem czarterowych lotów pasażerskich na samolotach B-737 400 (pierwszy tego typu samolot wprowadzono na rok przed wejściem inwestora, czyli w roku 2000) i B-747 800 (w 2003 r.). Wyżej wymienione operacje lotnicze wykonywano do marca 2003 r., kiedy to z powodu trudnych warunków na rynku międzynarodowym po atakach terrorystycznych z 11 września i wyjątkowo trudnej sytuacji na rynku wewnętrznym spółka poniosła duże straty i zawieszono przeloty czarterowe. 30 % akcji spółki wróciło do poprzedniego właściciela – Pana Zbigniewa Niemczyckiego, który jest do chwili obecnej w posiadaniu 100% akcji WEA.
W trakcie procesu restrukturyzacji, w latach 2003-2004 WEA rozszerzyła zakres działalności spółki-córki WEAC (bazy technicznej) przekazując jej wszystkie sprawy związane z utrzymaniem floty samolotowej. WEAC uzyskała także europejski certyfikat jakości JAR i PART 145, odpowiednio do certyfikatów WEA: JAR OPS 1 dla wszystkich typów samolotów zgodnie z AOC (WEA) czyli ATR 42-300 i 320, B-737 400 i 800, LET-410, Bell-407, Mi-8, Beechcraft Super KingAir 350.
W 2001 roku WEA podpisała nowy kontrakt z Pocztą Polską gwarantujący jej wyłączność na wykonywanie usługi przewozu poczty na terenie Polski przez następne 5 lat (pierwszy kontrakt podpisano w 1996 r.) czyli do marca 2006 r. Przedmiotowa umowa była wykonywana przez WEA przy wykorzystaniu 4 samolotów LET-410, jednego Mi-8, i jednego ATR 42. W połowie 2004 r., podjęto decyzję o restrukturyzacji floty WEA, a tym samym rozpoczęło wycofywanie z użycia starszych typów samolotów – helikoptera Mi-8 i LET-410 i wprowadzanie ATR 42 (w 2003 WEA była w posiadaniu dwóch tego typu samolotów).
W sierpniu 2004 r. zainicjowano zmianę modelu biznesowego firmy w kierunku działalności czarterowej – przeloty regularne i niereguralne, zarówno pasażerskie jak i towarowe wykonywane głównie przy wykorzystaniu samolotu typu ATR. WEA oferuje także usługi ACMI każdego typu jako wyspecjalizowany air-broker. Działalność na tym polu stale się rozwija ponieważ WEA jest postrzegana nie tylko jako broker, ale także jako linie lotnicze, mające do zaoferowania własny produkt. W 2004 WEA podpisała kontrakty z Polskimi, Niemieckimi oraz Włoskimi partnerami, usługi te są wykonywane w oparciu o samolotu typy ATR 42 300. WEA poszerzyła swoja flotę o następujące samoloty: King-350, Bell 407 i nowy BELL 427
W kwietniu WEA dodała do swojej floty trzeci samolot typu ATR 42-320 , o numerach rejestracyjnych SP-KCN, pierwszy samolot w wersji QC dostępny na polskim rynku, a w listopadzie następny: ATR 42-300, znowu w wersji QC, o numerze rejestracyjnym SP-KEE.
W Maju WEA rozpoczęła nowe przedsięwzięcie – loty pasażerskie z Dundee (Szkocja) do Birmingham I Belfastu. WEA operuje na własnych znakach (model ACMI plus) pod handlową nazwą Flywhoosh
Z przykrością informujemy, że pomimo wielu negocjacji i wysiłków w celu osiągnięcia porozumienia umożliwiającego kontynuację projektu Whoosh na terenie UK we współpracy z firmą BluArrow Aviation strony nie osiągnęły porozumienia co do kontynuowania projektu na dotychczasowych warunkach. Kontrakt na świadczenie usług lotniczych pomiędzy WEA a BluArrow (znanym także jako GoVisit) został wypowiedziany przez White Eagle Aviation SA w dniu 4 grudnia 2007 z winy BluArrow z powodu nie dotrzymania prez BluArrow warunków kontraktu (nieprzestrzeganie zobowiązań finansowych podczas gdy BluArrow pobierało wszystkie pieniądze za sprzedaż biletów) ze zobowiązaniem BluArrow do natychmistowego poinformowania pasażerów o zakończeniu projektu we współpracy z White Eagle Aviation SA. Jednakże informacja ta została oficjalnie opublikowana przez naszego brytyjskiego partnera na jego stronie internetowej dopiero 9 grudnia 2007.